Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D7E4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D7E4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D7E4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D7E4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D7E4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D7E4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D7E4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D7E4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D7E4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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