Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6X5

Slc52a3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a3Q9D6X5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc52a3Q9D6X5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms