Protein–RNA interactions for Protein: Q9D328

Tmem35a, Transmembrane protein 35A, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35aQ9D328 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem35aQ9D328 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms