Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N7

Chaf1b, Chromatin assembly factor 1 subunit B, mousemouse

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1bQ9D0N7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chaf1bQ9D0N7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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