Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ91

Srfbp1, Serum response factor-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srfbp1Q9CZ91 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srfbp1Q9CZ91 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srfbp1Q9CZ91 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srfbp1Q9CZ91 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Srfbp1Q9CZ91 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srfbp1Q9CZ91 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srfbp1Q9CZ91 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srfbp1Q9CZ91 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srfbp1Q9CZ91 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srfbp1Q9CZ91 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srfbp1Q9CZ91 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srfbp1Q9CZ91 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srfbp1Q9CZ91 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srfbp1Q9CZ91 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srfbp1Q9CZ91 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srfbp1Q9CZ91 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srfbp1Q9CZ91 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srfbp1Q9CZ91 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srfbp1Q9CZ91 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srfbp1Q9CZ91 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srfbp1Q9CZ91 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srfbp1Q9CZ91 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srfbp1Q9CZ91 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srfbp1Q9CZ91 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms