Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ChtopQ9CY57 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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