Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXJ4

Abcb8, ATP-binding cassette sub-family B member 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb8Q9CXJ4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Abcb8Q9CXJ4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms