Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Xrcc3Q9CXE6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Xrcc3Q9CXE6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Xrcc3Q9CXE6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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Xrcc3Q9CXE6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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Xrcc3Q9CXE6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Xrcc3Q9CXE6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Xrcc3Q9CXE6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Xrcc3Q9CXE6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Xrcc3Q9CXE6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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Xrcc3Q9CXE6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Xrcc3Q9CXE6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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Xrcc3Q9CXE6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrcc3Q9CXE6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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