Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RpainQ9CWY9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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