Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Smurf1Q9CUN6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smurf1Q9CUN6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms