Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC9

Gnpda2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda2Q9CRC9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gnpda2Q9CRC9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda2Q9CRC9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda2Q9CRC9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda2Q9CRC9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda2Q9CRC9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda2Q9CRC9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda2Q9CRC9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda2Q9CRC9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda2Q9CRC9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda2Q9CRC9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda2Q9CRC9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda2Q9CRC9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda2Q9CRC9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda2Q9CRC9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda2Q9CRC9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda2Q9CRC9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gnpda2Q9CRC9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gnpda2Q9CRC9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms