Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQF4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CQF4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CQF4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CQF4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CQF4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CQF4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CQF4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms