Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ88

Tspan31, Tetraspanin-31, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan31Q9CQ88 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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