Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpa3Q9CQ71 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms