Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ14

Trpd52l3, Tumor protein D52-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpd52l3Q9CQ14 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpd52l3Q9CQ14 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms