Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms