Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930550L24RikQ99PA7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930550L24RikQ99PA7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms