Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms