Protein–RNA interactions for Protein: Q99J36

Thumpd1, THUMP domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd1Q99J36 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Thumpd1Q99J36 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thumpd1Q99J36 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms