Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms