Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxapQ8VCG9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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