Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W5

Tsen15, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen15, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsen15Q8R3W5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsen15Q8R3W5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsen15Q8R3W5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsen15Q8R3W5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsen15Q8R3W5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsen15Q8R3W5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsen15Q8R3W5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsen15Q8R3W5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsen15Q8R3W5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsen15Q8R3W5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsen15Q8R3W5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsen15Q8R3W5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsen15Q8R3W5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsen15Q8R3W5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsen15Q8R3W5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsen15Q8R3W5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsen15Q8R3W5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsen15Q8R3W5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsen15Q8R3W5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsen15Q8R3W5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsen15Q8R3W5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsen15Q8R3W5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsen15Q8R3W5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsen15Q8R3W5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsen15Q8R3W5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsen15Q8R3W5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsen15Q8R3W5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsen15Q8R3W5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsen15Q8R3W5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsen15Q8R3W5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsen15Q8R3W5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsen15Q8R3W5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsen15Q8R3W5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms