Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms