Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms