Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms