Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg4aQ8C9S8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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Atg4aQ8C9S8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg4aQ8C9S8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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