Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cwc22Q8C5N3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cwc22Q8C5N3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms