Protein–RNA interactions for Protein: Q8C050

Rps6ka5, Ribosomal protein S6 kinase alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka5Q8C050 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6ka5Q8C050 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms