Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA0

Lrfn5, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn5Q8BXA0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrfn5Q8BXA0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms