Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW41

Pomgnt2, Protein O-linked-mannose beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pomgnt2Q8BW41 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pomgnt2Q8BW41 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pomgnt2Q8BW41 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pomgnt2Q8BW41 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pomgnt2Q8BW41 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pomgnt2Q8BW41 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pomgnt2Q8BW41 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pomgnt2Q8BW41 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pomgnt2Q8BW41 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms