Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHK2

Scn3b, Sodium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3bQ8BHK2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3bQ8BHK2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms