Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms