Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
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Ttc29Q80VM3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Ttc29Q80VM3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Ttc29Q80VM3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Ttc29Q80VM3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Ttc29Q80VM3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc29Q80VM3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms