Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pja2Q80U04 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms