Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cul9Q80TT8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cul9Q80TT8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms