Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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