Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms