Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc57Q6PHN1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms