Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms