Protein–RNA interactions for Protein: Q64735

Cr1l, Complement component receptor 1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cr1lQ64735 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cr1lQ64735 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cr1lQ64735 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cr1lQ64735 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cr1lQ64735 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cr1lQ64735 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cr1lQ64735 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cr1lQ64735 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cr1lQ64735 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cr1lQ64735 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cr1lQ64735 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cr1lQ64735 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cr1lQ64735 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cr1lQ64735 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cr1lQ64735 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cr1lQ64735 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cr1lQ64735 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cr1lQ64735 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cr1lQ64735 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cr1lQ64735 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cr1lQ64735 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cr1lQ64735 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cr1lQ64735 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cr1lQ64735 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cr1lQ64735 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cr1lQ64735 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cr1lQ64735 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cr1lQ64735 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cr1lQ64735 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cr1lQ64735 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cr1lQ64735 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cr1lQ64735 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cr1lQ64735 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cr1lQ64735 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cr1lQ64735 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cr1lQ64735 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cr1lQ64735 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cr1lQ64735 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cr1lQ64735 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cr1lQ64735 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cr1lQ64735 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cr1lQ64735 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cr1lQ64735 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cr1lQ64735 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cr1lQ64735 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cr1lQ64735 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cr1lQ64735 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cr1lQ64735 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cr1lQ64735 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms