Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Lcn3Q62471 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Lcn3Q62471 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Lcn3Q62471 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Lcn3Q62471 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Lcn3Q62471 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Lcn3Q62471 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Lcn3Q62471 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Lcn3Q62471 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Lcn3Q62471 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Lcn3Q62471 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Lcn3Q62471 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Lcn3Q62471 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Lcn3Q62471 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lcn3Q62471 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lcn3Q62471 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lcn3Q62471 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lcn3Q62471 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lcn3Q62471 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lcn3Q62471 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lcn3Q62471 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lcn3Q62471 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lcn3Q62471 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lcn3Q62471 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn3Q62471 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn3Q62471 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn3Q62471 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn3Q62471 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn3Q62471 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn3Q62471 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn3Q62471 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn3Q62471 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn3Q62471 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn3Q62471 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms