Protein–RNA interactions for Protein: Q62193

Rpa2, Replication protein A 32 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa2Q62193 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpa2Q62193 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpa2Q62193 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpa2Q62193 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpa2Q62193 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpa2Q62193 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpa2Q62193 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpa2Q62193 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpa2Q62193 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpa2Q62193 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpa2Q62193 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpa2Q62193 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms