Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccne1Q61457 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Ccne1Q61457 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Ccne1Q61457 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccne1Q61457 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms