Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Usf1Q61069 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usf1Q61069 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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