Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Neurod1Q60867 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms