Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc5a6Q5U4D8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms