Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp22Q5DU02 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms