Protein–RNA interactions for Protein: Q571B6

Whamm, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhammQ571B6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WhammQ571B6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms