Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms