Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C3

Nutm2, NUT family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nutm2Q3V0C3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nutm2Q3V0C3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nutm2Q3V0C3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms